Baby Assassins Chisato và Mahiro là hai cô gái trung học sắp tốt nghiệp. Họ cũng tình cờ là những sát thủ có kỹ năng cao.Khi tổ chức mà họ làm việc ra lệnh cho họ ở chung một phòng, mối quan hệ giữa hai người nhanh chóng trở nên tồi tệ.Tuy nhiên, khi họ thấy mình bị yakuza nhắm đến, các cô gái nhanh chóng nhận ra rằng họ sẽ phải tìm cách để làm việc cùng nhau.
