Trái Cây Vùng Grisaia Học viện tư thục Mihama – thoạt nhìn có vẻ là một ngôi trường bình thường, nhưng thực chất nơi đây chỉ có 5 học sinh, và tất cả đều là những người mang hoàn cảnh đặc biệt. Một ngày nọ, học viện chào đón học sinh thứ sáu – Kazami Yuuji – người cũng mang trong mình một cái tôi mạnh mẽ và khác biệt chẳng kém gì những người còn lại. Trong quá trình sống và tiếp xúc với nhau, giữa họ dần nảy sinh sự thấu hiểu, những tác động qua lại nhỏ bé từng chút một bắt đầu chạm đến nội tâm của từng người. Và rồi, những câu chuyện quá khứ từng bị giam cầm trong lòng các cô gái ấy… bắt đầu chuyển động.
