Thần Võ Thiên Tôn 3D Cửu giới chỉ có một Thể tu Chí tôn, thảm thay bị bằng hữu thân thiết Lệ Vân Phi phản bội, thân tử đạo tiêu. Trong một cơ duyên kỳ ngộ, thần hồn của ông vẫn được giữ nguyên không bị tiêu diệt và bất ngờ nhập vào người của một đệ tử đang hấp hối của Lăng Vân Môn là Tiêu Trần. Trọng sinh một lần nữa, ông thức tỉnh được thần thông vô thượng và đi ra con đường thần thông của riêng mình dưới danh nghĩa "Chư Thiên Tôn." Ông chiêu nạp những đệ tử có tài nghệ cao cường và nhận nuôi một con quái thú làm thú cưng tên là "Tiểu Hắc," đồng thời kết giao với hồng nhan tri kỷ của mình là Khương Manh. Tiêu Trần thông qua trí tuệ và thần thông vô địch của mình, nhanh chóng mở rộng thế lực, quét sạch lục giới, thống nhất Thiên Nguyên Vực, chấm dứt hoàn toàn mấy trăm năm chiến tranh và hỗn loạn tại Thiên Nguyên Vực.
