Rồng Của Wonderhatch Cốt truyện tập trung vào hai nhân vật chính, Nagi và Thaim. Nagi, được lồng tiếng bởi Sena Nakajima, là một nữ sinh trung học ở thế giới thực với khả năng đặc biệt là synesthesia âm thanh-màu sắc, cho phép cô nhìn thấy màu sắc khi nghe thấy âm thanh nhất định. Thaim, được lồng tiếng bởi Daiken Okudaira, đến từ thế giới Upananta và có một khuyết điểm theo quan điểm của thế giới mình: anh không thể nghe thấy tiếng của rồng. Câu chuyện xoay quanh cuộc gặp gỡ của họ và mối quan hệ hình thành, thách thức những ràng buộc truyền thống của cả hai thế giới.
