Hiệp Sĩ Sidonia Sau khi Trái Đất bị hủy diệt bởi những dạng sống bí ẩn của người ngoài hành tinh được gọi là Gauna, những tàn tích còn sót lại của loài người đã trốn thoát vào không gian trên con tàu thế hệ khổng lồ Sidonia. Sau khi trôi dạt trong không gian trong nhiều thiên niên kỷ, Sidonia một lần nữa thấy mình bị Gauna tấn công lần đầu tiên sau một thế kỷ. Một lần nữa đối mặt với mối đe dọa tuyệt chủng, một chiến thắng tạm thời trước Gauna đã được giành được nhờ Tsumugi Shiraui, người lai giữa người và Gauna và phi công máy móc Guardian xuất sắc Nagate Tanikaze. 10 năm sau... Người dân Sidonia tận hưởng một khoảng thời gian nghỉ ngơi ngắn ngủi. Những ngày yên bình trôi qua, trong thời gian đó Tsumugi bắt đầu nhận ra tình cảm của mình dành cho Nagate, người hiện được tôn vinh là anh hùng của Sidonia. Tuy nhiên, như thuyền trưởng Kobayashi luôn biết, chừng nào Gauna còn tồn tại, hòa bình không thể kéo dài. Quyết định được đưa ra: một trận chiến cuối cùng, quyết định số phận của những người sống sót cuối cùng của nhân loại. Khi ngày tận thế đến gần, liệu phi hành đoàn có thể bảo vệ những người họ yêu thương không?
