Danganronpa 3: Chương Tuyệt Vọng Tại Học viện tư thục Đỉnh Hy Vọng, có một dự án bí ẩn được thực hiện. Cuộc gặp gỡđịnh mệnh xảy đến với Hajime Hinata, một cậu bé trong khoa dự bị luôn khao khát có được tài năng, đã đưa học viện đi theo một hướng không thể đoán trước được tương lai. Đây là câu chuyện về sự kiện tuyệt vọng, tồi tệ nhất trong lịch sử nhân loại.
