Bí Mật Bóng Tối Phim kể về 10 năm trước một vùng đất bí hiểm được gọi là Hells Gate xuất hiện ở Tokyo. Trên bầu trời đêm các ngôi sao thật được thay bằng các ngôi sao giả. Trong khoảng thời gain này, đồng thời xuất hiện những người có năng lực đặc biệt được biết đến với tên gọi là Contractor. Họ bị người đời coi là những quái vật, cỗ máy giết người.... Sự tồn tại của họ được giữ bí mật với công chúng và các quốc gia trên thế giớ sử dụng họ như những gián điệp, sát thủ vì lợi ích của mỗi nước...
