Atom No Ko Azumi Nayuta là một nhà phát triển trò chơi thần đồng trẻ tuổi, người sản xuất trò chơi một cách riêng tư dưới cái tên John Doe mà không có bất kỳ liên kết nào với công ty hoặc nhà phân phối lớn. Nayuta thường được biết đến với biệt danh Banksy của ngành công nghiệp trò chơi vì không ai biết danh tính thực sự của anh ta, nhưng một sự cố đã khiến anh ta rời bỏ công việc phát triển trò chơi. Tuy nhiên, câu chuyện bắt đầu khi Atom, một nhà sản xuất đồ chơi lâu đời đang trên bờ vực phá sản, bắt đầu tìm kiếm anh ta để xây dựng lại công việc kinh doanh của mình.
